Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
CubnQ9JLB4 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms