Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ap3m1Q9JKC8 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms