Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lmbr1Q9JIT0 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms