Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ1

Tlr1, Toll-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr1Q9EPQ1 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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Tlr1Q9EPQ1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tlr1Q9EPQ1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
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