Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC8

Tomm20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20Q9DCC8 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Tomm20Q9DCC8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm20Q9DCC8 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm20Q9DCC8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm20Q9DCC8 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm20Q9DCC8 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm20Q9DCC8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm20Q9DCC8 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm20Q9DCC8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm20Q9DCC8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm20Q9DCC8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm20Q9DCC8 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm20Q9DCC8 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm20Q9DCC8 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm20Q9DCC8 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm20Q9DCC8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm20Q9DCC8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm20Q9DCC8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm20Q9DCC8 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm20Q9DCC8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm20Q9DCC8 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm20Q9DCC8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tomm20Q9DCC8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms