Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Subh2bvQ9D9Z7 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms