Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Snx20Q9D2Y5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms