Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Snapc3Q9D2C9 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC12.4□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Snapc3Q9D2C9 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms