Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnot11Q9CWN7 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Cnot11Q9CWN7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Cnot11Q9CWN7 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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