Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Higd2aQ9CQJ1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Higd2aQ9CQJ1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms