Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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