Protein–RNA interactions for Protein: Q99PE5

Smim3, Small integral membrane protein 3, mousemouse

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim3Q99PE5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Smim3Q99PE5 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
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