Protein–RNA interactions for Protein: Q99P51

Rassf3, Ras association domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf3Q99P51 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rassf3Q99P51 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rassf3Q99P51 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms