Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
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Ddb2Q99J79 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Ddb2Q99J79 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
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Ddb2Q99J79 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Ddb2Q99J79 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Ddb2Q99J79 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Ddb2Q99J79 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Ddb2Q99J79 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Ddb2Q99J79 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
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