Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Abhd14b-210ENSMUST00000217496 631 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cul7Q8VE73 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms