Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Brd3Q8K2F0 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Brd3Q8K2F0 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms