Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ercc8Q8CFD5 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
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