Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc27Q8CD92 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc27Q8CD92 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc27Q8CD92 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc27Q8CD92 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ttc27Q8CD92 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ttc27Q8CD92 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Ttc27Q8CD92 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ttc27Q8CD92 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ttc27Q8CD92 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ttc27Q8CD92 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ttc27Q8CD92 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ttc27Q8CD92 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ttc27Q8CD92 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ttc27Q8CD92 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Ttc27Q8CD92 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ttc27Q8CD92 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ttc27Q8CD92 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Ttc27Q8CD92 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ttc27Q8CD92 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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