Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Klrd1-202ENSMUST00000112063 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 2210414B05Rik-201ENSMUST00000139600 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm3594-201ENSMUST00000169152 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm2691-201ENSMUST00000203205 901 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm7443-201ENSMUST00000206355 378 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 AC124537.2-201ENSMUST00000220872 883 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Serpinb9d-201ENSMUST00000067198 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm45177-201ENSMUST00000209104 2307 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trim35Q8C006 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trim35Q8C006 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trim35Q8C006 Gm12171-201ENSMUST00000150895 1257 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm21970-201ENSMUST00000160764 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trim35Q8C006 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trim35Q8C006 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trim35Q8C006 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Trim35Q8C006 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm14599-201ENSMUST00000120469 474 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Vmn1r-ps102-201ENSMUST00000120663 886 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm14902-201ENSMUST00000145576 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Trim35Q8C006 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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