Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Atg4bQ8BGE6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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