Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sbno2Q7TNB8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms