Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Krt9Q6RHW0 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Krt9Q6RHW0 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms