Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Krt40Q6IFX3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Krt40Q6IFX3 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Krt40Q6IFX3 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Krt40Q6IFX3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Krt40Q6IFX3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms