Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Zfp248Q640N4 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Zfp248Q640N4 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Zfp248Q640N4 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Zfp248Q640N4 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Zfp248Q640N4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Zfp248Q640N4 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Zfp248Q640N4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Zfp248Q640N4 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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Zfp248Q640N4 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Zfp248Q640N4 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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