Protein–RNA interactions for Protein: Q64092

Tfe3, Transcription factor E3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfe3Q64092 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tfe3Q64092 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tfe3Q64092 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms