Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

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Length 803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Tsr1Q5SWD9 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tsr1Q5SWD9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tsr1Q5SWD9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tsr1Q5SWD9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tsr1Q5SWD9 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tsr1Q5SWD9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tsr1Q5SWD9 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tsr1Q5SWD9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tsr1Q5SWD9 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Tsr1Q5SWD9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tsr1Q5SWD9 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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Tsr1Q5SWD9 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Tsr1Q5SWD9 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tsr1Q5SWD9 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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