Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Mir433-201ENSMUST00000093564 124 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Fam208bQ5DTT3 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms