Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Syne3Q4FZC9 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms