Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD5

Prdm6, Putative histone-lysine N-methyltransferase PRDM6, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm6Q3UZD5 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Prdm6Q3UZD5 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Prdm6Q3UZD5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Prdm6Q3UZD5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Prdm6Q3UZD5 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Prdm6Q3UZD5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Prdm6Q3UZD5 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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Prdm6Q3UZD5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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Prdm6Q3UZD5 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Prdm6Q3UZD5 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms