Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC9.37□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Cops9Q3U898 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.35□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms