Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Ssbp4Q3U4B1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Ssbp4Q3U4B1 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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