Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ulk3Q3U3Q1 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ulk3Q3U3Q1 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms