Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rufy4Q3TYX8 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rufy4Q3TYX8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rufy4Q3TYX8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rufy4Q3TYX8 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rufy4Q3TYX8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rufy4Q3TYX8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rufy4Q3TYX8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rufy4Q3TYX8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rufy4Q3TYX8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms