Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Lrrc28Q3TX51 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms