Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Kcnma1Q08460 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Kcnma1Q08460 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms