Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scg2Q03517 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Scg2Q03517 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms