Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sec23aQ01405 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms