Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gjb2Q00977 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms