Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Irx1P81068 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Irx1P81068 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms