Protein–RNA interactions for Protein: P61080

Ube2d1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d1P61080 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Ube2d1P61080 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Ube2d1P61080 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms