Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
P58686 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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P58686 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
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P58686 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
P58686 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
P58686 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
P58686 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms