Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Setd4P58467 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Setd4P58467 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms