Protein–RNA interactions for Protein: P47242

Pax9, Paired box protein Pax-9, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax9P47242 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pax9P47242 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms