Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

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Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sdc2P43407 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sdc2P43407 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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