Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Zfp516-202ENSMUST00000171238 7725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Zfp516-201ENSMUST00000071233 7703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Apoc3P33622 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Tns2-201ENSMUST00000046144 4718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms