Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nedd1P33215 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nedd1P33215 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms