Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Hoxc5P32043 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms