Protein–RNA interactions for Protein: P30282

Ccnd3, G1/S-specific cyclin-D3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd3P30282 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccnd3P30282 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccnd3P30282 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms