Protein–RNA interactions for Protein: P28563

Dusp1, Dual specificity protein phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dusp1P28563 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dusp1P28563 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dusp1P28563 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dusp1P28563 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dusp1P28563 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dusp1P28563 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dusp1P28563 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dusp1P28563 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dusp1P28563 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dusp1P28563 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dusp1P28563 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dusp1P28563 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dusp1P28563 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dusp1P28563 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dusp1P28563 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dusp1P28563 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Dusp1P28563 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dusp1P28563 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dusp1P28563 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dusp1P28563 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dusp1P28563 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dusp1P28563 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dusp1P28563 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Dusp1P28563 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Dusp1P28563 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms