Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ggta1P23336 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ggta1P23336 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Ggta1P23336 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ggta1P23336 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ggta1P23336 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ggta1P23336 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ggta1P23336 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ggta1P23336 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Ggta1P23336 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Ggta1P23336 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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